遗传分析解读解决方案

利用摩杜云FPGA计算加速和机器学习算法,为医疗用户提供精准、智能化的遗传分析解读服务。

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合作伙伴介绍


人和未来生物科技有限公司是一家以基因科技为核心,以基因大数据与人工智能 为支撑,为医疗健康行业提供精准解决方案的高新
技术企业。公司团队自2009 年开始在美国圣地亚哥实验室开展二代测序技术研究,2014年成立人和未来生 物科技有限公司,现已
形成集研发、生产、销售以及第三方独立医学检验所服务 为一体的完整产业链。

体验内容介绍

通过操作系统中的两个场景,体验从FastQ文件到解读结果的全流程服务,感受数十倍的基因计算加速和精准的智能解读。

解决方案使用GTX.Digest基因数据解读平台,综合利用云计算和大数据的能力,在几分钟内即可完成基因变异鉴定和相关疾病的知识解读。

体验场景描述

体验场景中提供了两个案例场景,均为WES解读。采用传统计算流程,从WES测序原始数据文件到解读的全流程计算需要4至6个
小时;在摩杜云批量计算中的WDL流程控制下,系统自动启动摩杜云平台的FPGA基因数据加速实例完成计算分析和变异解读,可
快速、便捷、稳定地将上述计算服务加速到6至7分钟完成。

结果页面按基因的致病性列出基因及其变异的解读结果。案例一的结果显示IDUA为最可能的致病基因,对应的致病突变为c.152
G>A;案例二的结果显示KCNT1为最可能的致病基因,对应的致病突变为c.1283G>A。ACMG,Clinvar和人和未来dmVar数
据库均支持上述结论,OMIM、Orphanet数据库显示疾病的注释结果与病例的HPO表型一致,饼图展示的文本挖掘结果可以直
接查看文献对该变异和疾病的描述。案例一的结果显示IDUA为最可能的致病基因,对应的致病突变为c.152G>A;案例二的结果
显示KCNT1为最可能的致病基因,对应的致病突变为c.1283G>A。ACMG,Clinvar和人和未来dmVar数据库均支持上述结论,
OMIM、Orphanet数据库显示疾病的注释结果与病例的HPO表型一致,饼图展示的文本挖掘结果可以直接查看文献对该变异和
疾病的描述。

案例一解读结果

案例二解读结果

解读结果页面最上端的“过滤设置”提供了丰富的动态组合过滤选项,“基因Panel”列出了90多种常见遗传病的基因组,上述功能可
让用户快速定位感兴趣的目标突变;“标记”功能方便用户标注致病变异,自动生成检测报告。 “帮助中心”提供了系统使用方法与功
能介绍。

方案优势

将患者基因检测数据与疾病表型信息相结合,通过对基因数据的计算分析和智能解读,获得基因的致病性排序,协助临床遗传专家与科研
人员快速筛选出致病突变,查看突变的详细信息,并对相关基因突变进行精准的文献定位。

强大的 FPGA加速能力,基因数据分析性能提升数十倍

利用FPGA将对基因计算分析流程进行加速处理,计算能力得到大幅度提升,原来4~6个小时的计算流程,可加速至6~7分钟完成。

超大规模文本挖掘,辅助专家进行快速解读

对PubMed上3000万篇文献摘要和500万篇全文进行超大规模的文本挖掘,利用机器学习算法,智能提炼基因突变与疾病间的关联关系,形成文本挖掘数据库dmVar,辅助基因突变的快速解读与文献的精准定位。

智能化致病性分析,精准筛选致病基因与突变

以真实数据作为训练样本,提取基因和变异相关的特征,利用神经网络技术构建智能排序模型,在基因和变异两个维度实现致病性排序。

完善的家系解读,支持多人、多代家系分析

支持多人、多代家系成员的复杂解读分析,综合考虑家系成员的基因突变情况,通过机器学习建模,提高致病性分析的准确性。

标签
生命科学 AI算法 临床全基因组分析 遗传病检测
体验时长
5-10分钟
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